Unidade Campus Manguinhos:
O espaço físico da Creche está dividido em quatro blocos:
O primeiro bloco compreende a secretaria, vestiário feminino, sala da Coordenação do Serviço da Creche, almoxarifado de materiais de limpeza, sala da saúde do trabalhador e sala de RH.
O segundo bloco possuiu quatro salas para atividades com crianças, sendo duas destinadas aos berçários. Há ainda o banheiro infantil, uma sala de apoio para os trabalhadores, a sala da Equipe Pedagógica e ainda uma cozinha para atender as crianças dos berçários.
O terceiro bloco: sete salas voltadas às atividades das crianças. E também, um almoxarifado pedagógico e sala de Professores de oficinas.
O quatro bloco é composto por dois banheiros infantis, uma despensa de alimentos; uma cozinha de porte industrial, refeitório infantil; sala de saúde; sala da equipe técnica; sala do Núcleo de Ensino e Pesquisa em Educação e Saúde para Infância, mais dois banheiros para adultos e sala de apoio administrativo.
Unidade do Instituto Fernandes Figueira IFF:
Inaugurada em setembro de 1990, e está localizada na Avenida Rui Barbosa, 716, 3º andar, Flamengo - Rio de Janeiro. Na unidade Instituto Fernandes Figueira - IFF/Fiocruz, sua capacidade de atendimento é para 52 (cinquenta e dois) crianças.
O espaço está organizado da seguinte forma:
Os espaços internos e externos são utilizados para a realização de diversas atividades como: Oficinas de Contação de Histórias; Teatro; Música; Corpo e Movimento; Horta; Atividades diversificadas, como: pintura, colagem, jogos, massinha, desenho, brincar, entre outras.